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目前有机棉认证主要有全球纺织品标准（GOTS）认证、有机含量标准（OCS）认证，这两大体系。(一般做过GOTS认证，客户不会要求再做OCS。但是做过OCS认证可能会被要求做GOTS)
有机纺织标准，简称GOTS。该标准由国际天然纺织品协会（IVN）、日本有机棉协会（JOCA），美国有机贸易协会（OTA）和英国土壤协会（SA）组成的GOTS国际工作组IWG共同制定和发布。
全球有机纺织品认证标准（GOTS）的主要定义是确保纺织品有机状态方面的要求，包括原材料的收割，对环境和社会责任的生产，以及标识、以确保消费者对产品的信息。
该标准对有机纺织品的加工、制造、包装、标签，进出口及分销都作出了相关的条款。最终产品可能包括，但并不限于：纤维产品、纱线、织物、衣服和家用纺织品，本标准只关注强制性要求。
有机含量标准，简称OCS。该标准通过跟踪有机原材料的种植从而监管整个有机产业链。Textile Exchange表示，OCS将取代现有的OE(Organic Exchange)混纺标准。此外，OCS将应用于各种有机种植原料的验证，而不只限于有机棉。
有机物含量标准(OCS）能够应用于所有含有5%-100%有机原料的非食品产品。此标准能够用于证实最终产品中的有机原料含量。
它能够用于从原料源头追溯至最终产品且此过程都有一个可信的第三方组织进行认证。在完全独立评估产品有机含量的过程中，标准将秉承透明性和一致性。此标准可以作为公司之间的商务工具用以帮助企业确保其购买的或支付的产品是符合其要求的。
二者的不同之处在于：
一、内容不同：
OCS仅仅是产品的生产管理。
GOTS确包含三方面；产品生产管理，环境保护，社会责任。
二、证对象不同：
OCS认证的对象是用认可的有机原料生产度的使用非食品产品。
GOTS认证仅限于用有机天然纤维生产的纺织品。
